ＨＩＶが最初に感染すると、大方の人々は軽いインフルエンザ様の疾患か、ときには、伝染性単核球症（腺熱）のような発熱とリンパ腺の腫れを伴うより重い病気になる。
この段階では、血液中のＨＩＶのレベルは非常に高く、ウイルスはＣＤ４Ｔ細胞のなかにいて体の全体に広がっており、脳にさえも入り込む。
しかし二～三週間して免疫応答が十分に活動し始めると、この感染は制御されるようになる。
論争をした。
漏洩があり、告発があり、主張があり、反訴があったが、調査はもたつきながらも一九九二年に最終結論に達した。
漏洩した文書によると、Ｇは「職業的および科学的倫理の容認された標準に対する無視」を反映する「私利的行動」をとったとして非難されていたが、彼は科学的不正行為の罪を犯したとはされていなかった。
しかし、この文書は、Ｇ・グループ側に不正行為があったと結論していた。
たとえば、「調査結果はエイズ論文のデータを偽造と結論」と題する新聞記事は、Ｇの一０年来の助手Ｍ・Ｐを、真実と正確さに対する尊重を欠いていたとして公然と非難した。
数年後これらの非難は科学保全局によって取り下げられたため、ＧとＰの容疑はいくらか晴れることになった。
どのような真実がこの事件の裏にあるにせよ、今日の科学者たちが直面している問題のひとつを表していることは確かである。
結果を得て、それを最初に発表しなければならない圧力がある限り、将来もこれに類した一層多くの事件が引き起こされることであろう。
当人は回復し、平均一０年間は健康な状態が続く。
しかし、この潜伏性ウイルスは除去されることはない。
なぜならば、このウイルスは感染した細胞のＤＮＡに組み込まれており、これらの細胞が分裂するたびにこっそりと増殖しているからである。
しかし、人から人に広がるためには、このウイルスは新しいウイルスを生産しなければならないのであるが、この際に、感染したＣＤ４細胞はＨＩＶたんぱく質をつくり、そしてこのＨＩＶたんぱく質が免疫攻撃を招くことになる。
最初は、抗体とキラーＴ細胞が、ＨＩＶが体のなかに広がるのを抑制する。
しかしこのウイルスは、主に突然変異によって免疫機構を回避する達人なのである。
ウイルスは増殖するたびに突然変異体を吐き出し、それらのいくつかはキラーＴ細胞の認識を逃れるであろう。
自然淘汰が卓越的に働いているので、突然変異体は、Ｔ細胞に依然認識されている非変異体よりも有利に選択されるので、猛烈に増殖する。
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